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UGA为首的门户持有钥匙开锁glycoscience

意志纽约矗立在复杂碳水化合物研究中心的大型MRI设备之前。 (UGA照片)

聚糖,或复合糖,覆盖所述表面 我们的细胞并发挥生物过程,从与其它细胞识别和打击病原体相互作用的关键作用。与癌症,例如,它们介导影响肿瘤发展的机制控制细胞分裂,生长和迁移率。

聚糖是无处不在的,但是复杂,需要研究者了解多学科,以探讨其在健康和疾病的作用。但一个新的信息学的门户,格鲁吉亚领导团队的一所大学建,是弥合这种差距,并帮助照亮glycoscience的世界。

创建glygen的

UGA与乔治·华盛顿大学合作创建glygen(glygen.org),由美国国家卫生研究所1000万$捐款资助,glycoscience信息学门户。 glygen以统一的方式一起带来了不同的信息,减少了那些新的glycoscience的学习曲线。

这是一个具有挑战性的项目,根据UGA的威廉·约克,联合首席研究员。

“我们正在整合不同类型的多学科信息一个储存在不同的地方,并将其提供给科学家的方式,让他们认识到存在的关系,说:”纽约,在艺术的富兰克林大学生物化学和分子生物学教授,科学和的构件 复合碳水化合物研究中心.

数据集成团队由拉贾mazumder,联合首席研究员,并在医学和健康科学的乔治·华盛顿大学的学校生物化学和分子医学副教授领导。

两年内进入为期五年的项目,团队已经推出glygen,并寻求反馈用户指导发展的下一个阶段。仍然有很长的路要走,但纽约是高兴与球队的进步。

“这是一个良好的开端,”他说。 “没有其他的聚糖和glycoscience资源,在那里,如集成。”

在狂野的西部创造莎士比亚

学习与聚糖是在像生物学或生物化学相关领域的大家,即使是专家有挑战性的工作,有提升的学习曲线,根据纽约。

“你不能成为一个专家在短短的一个区域,了解glycoscience,”他说。 “你必须有一个真正的多学科的观点。”

不像核酸,蛋白质和脂质,不会从DNA指导的模板创建聚糖。他们是受多个基因和环境因素的复杂过程的产物。

“理解聚糖是如何制造并不简单,但它的关键了解他们在生物体是如何工作的,”约克说。 “结构复杂且知之甚少,因此,它们之间的关系。”

问题更加复杂,glycoscience数据目前居住在许多地方,并使用一致的语言没有描述。

glygen需要来自不同源的数据,并创建一个统一的语言,因此,从一个源的信息可以被关联到来自另一源的信息。

“我们会考虑如何以均质化数据的语义方面因此它可以使用,因此,研究人员可以使相关的其他类型的数据,”约克说。 “到目前为止,它一直是一个有点像狂野的西部。”

我们的目标是描述的方式,有意义的大家,一个艰难的命题当被摄物体glycoscience的事情,根据纽约。

“例如,有英语,然后有莎士比亚,”他说。 “具有英语是一个美妙的,神奇的事情。但莎士比亚是在上面的另一层,连带我们去的东西多一点深刻。”

隐藏人物

聚糖在几乎每一个生物过程,你可以想像发挥中心作用,根据纽约。

“所有的生物都具有聚糖,如果你摆脱他们,你有一个有机体,是生病或不能生活,”他说。 “表示他们参与的关键机制,使生活。”

当癌症存在,了解聚糖结构在健康与患病细胞提供了有关在哪里寻找引起的变化,药品提供了一个潜在目标的生物学机制的研究线索。

流感,聚糖起到病原体和宿主之间的相互作用的作用。当有流感的新菌株,或跳转品种(如禽流感病毒感染人类)的应变,即识别和处理聚糖变化,承认是感染是如何发生的部分分子。了解聚糖的作用在分子识别感染的初始阶段揭示光,并能提供洞察力导致新的方法来阻止它。

glygen将允许科学家进行数据比较,并在这方面提供一个环境连接。基于glycoscience突破最有前途的领域是在理解癌症,感染性疾病和涉及发展和营养问题,根据纽约。

“我们不会去解决这些问题glygen,但我们的工具和信息资源,将有助于科学家开发这些领域的具体假设,”他说。

“潜力是非常巨大的,这就是为什么我们这样做。”